BI2015 Next Generation Sequencing
Modulverantwortliche
- Prof. Dr. Franz Cemic
Lehrende
- Prof. Dr. Franz Cemic
- Prof. Dr. Andreas Peter Dominik
Vorausgesetzte Module
- Bioinformatik (B.Sc. 2012)
Kurzbeschreibung
Das Modul führt in die Sequenzierverfahren der zweiten und dritten Generation ein.
Inhalte
- NGS-Verfahren
- Probenpräparation
- Sequenzierung
- Analyse der NGS-Daten
Qualifikations- und Lernziele
Fachkompetenzen
- Die Studierenden können das im Praktikum verwendete Sequenzierverfahren der zweiten oder dritten Generation beschreiben und die relevanten Methodiken erläutern.
- Sie können die im Kurs vorgestellten Auswertesoftware von RNAseq-Experimenten anhand der dahinterliegenden statistischen Modelle beschreiben und sind in der Lage diese zu erläutern und darzustellen.
- Sie können die Prozessschritte bei Probenpräparation wiedergeben.
- Sie können Diagnoseplots zur differentiellen Genexpression richtig interpretieren.
Methodenkompetenzen (fachlich & überfachlich)
- Die Studierenden können eine Auswertung eines RNAseq-Experiments eigenständig durchführen.
- Sie sind in der Lage eine Pipeline zur Auswertung eines RNAseq-Experimentes zu implementieren.
Sozialkompetenzen
- Sie sind in der Lage im Team zusammen zu arbeiten und können ihre Arbeit vor der Seminaröffentlichkeit vorstellen und verteidigen.
Selbstkompetenzen
- Sie können allein oder in kleinen Teams selbständig eigene Werkzeuge programmieren.
- Die Studierenden können eigenständig Lehrinhalte erarbeiten, präsentieren und praktisch vertiefen.
ECTS-Leistungspunkte (CrP)
- 6 CrP
- Arbeitsaufwand 180 Std.
- Präsenzzeit 60 Std.
- Selbststudium 120 Std.
Lehr- und Lernformen
- 4 SWS
- Praktikum 2 SWS
- Seminar/Seminaristischer Unterricht 2 SWS
Studiensemester
- Bioinformatik (B.Sc. 2012)
Dauer
1 Semester
Häufigkeit des Angebots
Einmal im Jahr
Unterrichtssprache
Deutsch
Bonuspunkte
Nein
Bonuspunkte werden gemäß § 9 (4) der Allgemeinen Bestimmungen vergeben. Art und Weise der Zusatzleistungen wird den Studierenden zu Veranstaltungsbeginn rechtzeitig und in geeigneter Art und Weise mitgeteilt.
Prüfungsleistungen
Prüfungsvorleistung: Praktikumsleistung
Prüfungsleistung: Präsentation
Benotung
Die Bewertung des Moduls erfolgt gemäß §§ 9, ggf. 12 (Teilleistungen), ggf. 18 (Arbeiten, Kolloquien) der Allgemeinen Bestimmungen (Teil I der Prüfungsordnung).
Verwendbarkeit
Gemäß § 5 der Allgemeinen Bestimmungen (Teil I der Prüfungsordnung) Verwendbarkeit in allen Bachelorstudiengänge der THM möglich.
Literatur, Medien
- Wird in der Veranstaltung bekannt gegeben
Rechtliche Hinweise
- Diese Informationen geben den in den Online-Diensten für Studierende erfassten Datenbestand wieder.
- Die rechtskräftigen und damit verbindlichen Fassungen der Modulhandbücher finden Sie im Amtlichen Mitteilungsblatt der THM (AMB).
- Alle gültigen Prüfungsbestimmungen für die THM-Studiengänge können Sie außerdem in komfortabler Leseversion über den Downloadbereich auf der Homepage des Prüfungsamts einsehen.