BI2015 Next Generation Sequencing

Modulverantwortliche
  • Prof. Dr. Franz Cemic
Lehrende
  • Prof. Dr. Franz Cemic
  • Prof. Dr. Andreas Peter Dominik
Vorausgesetzte Module
Kurzbeschreibung
Das Modul führt in die Sequenzierverfahren der zweiten und dritten Generation ein.
Inhalte
  • NGS-Verfahren
  • Probenpräparation
  • Sequenzierung
  • Analyse der NGS-Daten
Qualifikations- und Lernziele

Fachkompetenzen

  • Die Studierenden können das im Praktikum verwendete Sequenzierverfahren der zweiten oder dritten Generation beschreiben und die relevanten Methodiken erläutern.
  • Sie können die im Kurs vorgestellten Auswertesoftware von RNAseq-Experimenten anhand der dahinterliegenden statistischen Modelle beschreiben und sind in der Lage diese zu erläutern und darzustellen.
  • Sie können die Prozessschritte bei Probenpräparation wiedergeben.
  • Sie können Diagnoseplots zur differentiellen Genexpression richtig interpretieren.

Methodenkompetenzen (fachlich & überfachlich)

  • Die Studierenden können eine Auswertung eines RNAseq-Experiments eigenständig durchführen.
  • Sie sind in der Lage eine Pipeline zur Auswertung eines RNAseq-Experimentes zu implementieren.

Sozialkompetenzen

  • Sie sind in der Lage im Team zusammen zu arbeiten und können ihre Arbeit vor der Seminaröffentlichkeit vorstellen und verteidigen.

Selbstkompetenzen

  • Sie können allein oder in kleinen Teams selbständig eigene Werkzeuge programmieren.
  • Die Studierenden können eigenständig Lehrinhalte erarbeiten, präsentieren und praktisch vertiefen.
ECTS-Leistungspunkte (CrP)
  • 6 CrP
  • Arbeitsaufwand 180 Std.
  • Präsenzzeit 60 Std.
  • Selbststudium 120 Std.
Lehr- und Lernformen
  • 4 SWS
  • Praktikum 2 SWS
  • Seminar/Seminaristischer Unterricht 2 SWS
Studiensemester
  • Bioinformatik (B.Sc. 2012)
Dauer
1 Semester
Häufigkeit des Angebots
Einmal im Jahr
Unterrichtssprache
Deutsch
Bonuspunkte

Nein

Bonuspunkte werden gemäß § 9 (4) der Allgemeinen Bestimmungen vergeben. Art und Weise der Zusatzleistungen wird den Studierenden zu Veranstaltungsbeginn rechtzeitig und in geeigneter Art und Weise mitgeteilt.

Prüfungsleistungen

Prüfungsvorleistung: Praktikumsleistung

Prüfungsleistung: Präsentation

Benotung
Die Bewertung des Moduls erfolgt gemäß §§ 9, ggf. 12 (Teilleistungen), ggf. 18 (Arbeiten, Kolloquien) der Allgemeinen Bestimmungen (Teil I der Prüfungsordnung).
Verwendbarkeit
Gemäß § 5 der Allgemeinen Bestimmungen (Teil I der Prüfungsordnung) Verwendbarkeit in allen Bachelorstudiengänge der THM möglich.
Literatur, Medien
  • Wird in der Veranstaltung bekannt gegeben

Rechtliche Hinweise