• Prof. Dr. Andreas Gogol-Döring

• Prof. Dr. Andreas Gogol-Döring

Keine

Grundlegende Kenntnisse in Molekularbiologie, Skriptprogrammierung und der Benutzung von Linux

Die Auswertung großer Mengen von DNA- oder RNA-Sequenzen, wie sie von High-Troughput-Sequencing-Verfahren generiert werden.

• Grundlegende Verarbeitungsschritte von HTS Daten, wie Qualitätskontrolle, Read Mapping, usw.,
• Unterschiedliche Anwendungen von HTS, wie z.B. RNA-Seq, ChIPSeq, usw.
• Integration und Verknüpfung unterschiedlicher Datensätze
• Methoden der Dateninterpretation unter Zuhilfenahme von Informationen aus öffentlichen Datenbanken
• Eigenständige Bearbeitung von HTS Daten im Rahmen eines Datenanalyseprojekts.

Fachkompetenzen

• Die Studierenden können grundlegende Methoden zur Verarbeitung von High-Throughput-Sequencing (HTS) Daten aus unterschiedlichen Anwendungen benennen und erklären.

Methodenkompetenzen (fachlich & überfachlich)

• Sie sind in der Lage, mit gängigen und mit selbst entwickelten Softwaretools HTS Daten auszuwerten, und sie miteinander und mit Informationen aus Datenbanken zu verknüpfen, um so zu biologisch relevanten Ergebnissen zu gelangen.

Sozialkompetenzen

• Sie können die von ihnen zur Datenanalyse verwendeten Methoden sowie die daraus gewonnenen Ergebnisse korrekt und verständlich darlegen und diskutieren.

Selbstkompetenzen

• 6 CrP
• Arbeitsaufwand 180 Std.
• Präsenzzeit 60 Std.
• Selbststudium 120 Std.

• 4 SWS
• Seminaristischer Unterricht 2 SWS
• Praktikum 2 SWS

• Bioinformatik (B.Sc. 2012)

Nein

Bonuspunkte werden gemäß § 9 (4) der Allgemeinen Bestimmungen vergeben. Art und Weise der Zusatzleistungen wird den Studierenden zu Veranstaltungsbeginn rechtzeitig und in geeigneter Art und Weise mitgeteilt.

Prüfungsvorleistung: Regelmäßige Teilnahme (mindestens 80% der Zeit), Projekt (Eigenverantwortliche Durchführung eines Datenanalyseprojekts)

Prüfungsleistung: Mündliche Prüfung

• Wird in der Veranstaltung bekannt gegeben.