• Prof. Dr. Andreas Gogol-Döring

• Prof. Dr. Franz Cemic
• Prof. Dr. Andreas Peter Dominik
• Prof. Dr. Andreas Gogol-Döring
• Prof. Dr. Cornelia Sigges

• Informatik (B.Sc. 2010)
  • Algorithmen und Datenstrukturen (CS1017)
• Bioinformatik (B.Sc. 2012)
  • Algorithmen und Datenstrukturen (CS1017)
• Ingenieur-Informatik (B.Sc. 2010)
  • Algorithmen und Datenstrukturen (CS1017)

Programmiererfahrung in einer Skriptsprache

Grundlegende Methoden für das Suchen, Vergleichen, Alignieren und Assemblieren von Sequenzdaten.

• Grundlegende Algorithmen und Datenstrukturen zur Analyse von Sequenzen (z.B. exakte und approximative Stringsuche, paarweises und multiples Sequenzalignment, Suffixarrays).
• Grundlegende algorithmische Techniken (z.B. dynamische Programmierung)
• Gängige Software zur Sequenzanalyse (z.B. Blast)
• Anwendung der Algorithmen in Praxisbeispielen

Fachkompetenzen

• Die Studierenden können grundlegende Algorithmen und Datenstrukturen zur Analyse von Sequenzen benennen und erklären.
• Sie können gängige bioinformatische Software zur Sequenzanalyse benennen und die verwendeten Algorithmen erklären.

Methodenkompetenzen (fachlich & überfachlich)

• Sie können einfache Anwendungsaufgaben aus der Sequenzanalyse mit Hilfe geeigneter Algorithmen lösen.
• Sie können die Leistungsparameter der Algorithmen und Datenstrukturen zur Analyse von Sequenzen abschätzen und sie implementieren.
• Sie können gängige bioinformatische Software zur Sequenzanalyse zur Lösung bioinformatischer Aufgaben anwenden.

Sozialkompetenzen

• Sie können Algorithmen auf Sequenzen als verständliche und präzise Handlungsabfolgen beschreiben.
• Sie können die Korrektheit und Adäquatheit der von ihnen eingesetzten algorithmischen Techniken begründen.

Selbstkompetenzen

• 6 CrP
• Arbeitsaufwand 180 Std.
• Präsenzzeit 90 Std.
• Selbststudium 90 Std.

• 6 SWS
• Seminaristischer Unterricht 4 SWS
• Praktikum 2 SWS

• Bioinformatik (B.Sc. 2012)
• Informatik (B.Sc. 2010)
• Ingenieur-Informatik (B.Sc. 2010)

Nein

Bonuspunkte werden gemäß § 9 (4) der Allgemeinen Bestimmungen vergeben. Art und Weise der Zusatzleistungen wird den Studierenden zu Veranstaltungsbeginn rechtzeitig und in geeigneter Art und Weise mitgeteilt.

Prüfungsvorleistung: Hausübungen (Anzahl der Hausübungen wird den Studierenden rechtzeitig und in geeigneter Weise bekannt gegeben.)

Prüfungsleistung: Klausur oder mündliche Prüfung (Art des Leistungsnachweises wird den Studierenden rechtzeitig und in geeigneter Weise bekannt gegeben.)

• Bioinformatik (B.Sc. 2012)
  • Bioinformatik in der Arzneistoffforschung (BI2002)

• Jones, N. C.; Pevzner, P. A.: An Introduction to Bioinformatics Algorithms. The MIT Press.
• Gusfield, D.: Algorithms on Strings, Trees and Sequences: Computer Science and Computational Biology. Cambridge University Press.
• Mäkinen, V.; Belazzougui, D.; Cunial, F.; Tomescu, A. I.: Genome-Scale Algorithm Design. Cambridge University Press.