Genomics / Proteomics

Modulnummer
BI2010
Modulverantwortlicher
  • Jürgen Hemberger
Dozent
  • Jürgen Hemberger
  • Prof. Dr. Harald Lange
Kurzbeschreibung

Genom-Projekte, Strategien der Genomsequenzierung; Transkriptom, Expressionsanalytik, SNP-Analytik, in situ- Hybridisierung, GFP-Techniken. Proteomics: Probenvorbereitung, 2D-Elektrophorese, Quantifizierung, DIGE, Massenspektrometrie, Quantifizierung überstabile Isotope, Protein-Microarrays; Proteininteraktionen, Systembiologie Next-Generation-Sequenzierung von Viren- und Bakteriengenomen.

Qualifikations- und Lernziele

Die Studierenden sind in der Lage:

  • komplexe Analysetechniken aus dem Bereich der funktionellen Genom-, Expressions- und Proteinanalytik zu verstehen
  • diese in einen Zusammenhang zur Beschreibung des Status von biologischen Systemen zu stellen
  • Methoden aus den Bereichen Genomics und Proteomics im Kontext molekularbiologischer Fragestellungen zielorientiert anzuwenden.
  • interdisziplinäre Problemstellungen an der Schnittstelle von Technik und biologischen Systemen zu analysieren und Problemlösungen zu erarbeiten.
  • ganzheitliche Systemanalysen komplexer Netzwerke zwischen Genom und Proteom zu erfassen und zu bewerten
  • Systembiologische Forschungsansätze nachzuvollziehen und ihre Bedeutung für das Verständnis lebender Systeme zu erkennen
  • Softwareprogramme und Datenbanken aus den Bereichen Genomics/Proteomics kompetent zu nutzen
  • ethische Fragestellungen, die in Zusammenhang mit einer öffentlichen Diskussion im Kontext gentechnologischer Verfahren und Methoden stehen, sachorientiert zu bewerten und eine persönlich Stellung zu beziehen
  • in einem gentechnischen/proteinchemischen Labor verantwortungs-bewusst, sauber und unter Wahrung der grundlegenden Hygiene- und Sicherheitsregeln zu arbeiten.
  • sich über das Gefahrenpotential der im Praktikum verwendeten Substanzen zu informieren und mit diesen sachgerecht umgehen.
Lerninhalte

Genomics:

  • Genom-Projekte, Strategien der Genomsequenzierung; Transkriptom, Expressionsanalytik, SNP-Analytik, in situ-Hybridisierung, GFPTechniken Proteomics:
  • Probenvorbereitung, 2D-Elektrophorese, Quantifizierung, DIGE, Massenspektrometrie, Quantifizierung über stabile Isotope, ProteinMicroarrays; Proteininteraktionen, Systembiologie Praktikum:
  • Next-Generation-Sequenzierung von Viren- und Bakteriengenomen
  • 2-D-Gelelektrophorese mit Spot-Identifizierung
Moduldauer (Semester)
1
Unterrichtssprache
Deutsch
Gesamtaufwand
6 CrP; 180 Stunden, davon etwa 60 Stunden Präsenzzeit.
Semesterwochenstunden
4
Lernformen

Vorlesung 2 SWS, Praktikum 1 SWS, Seminar 1 SWS

Geprüfte Leistung

Prüfungsvorleistung: Erfolgreiche Teilnahme am Praktikum

Prüfungsleistung: Klausur

Bewertungsstandard

Bewertung der Prüfungsleistung nach § 9 der Prüfungsordnung (Teil I)

Häufigkeit des Angebots
Einmal im Jahr
Literatur
  • Wird in der Vorlesung bekannt gegeben