Genomics / Proteomics

Modulnummer
BI2010
Modulverantwortliche
Jürgen Hemberger
Dozenten
  • Jürgen Hemberger
  • Harald Andreas Lange
  • Kurzbeschreibung

    Genom-Projekte, Strategien der Genomsequenzierung; Transkriptom, Expressionsanalytik, SNP-Analytik, in situ- Hybridisierung, GFP-Techniken. Proteomics: Probenvorbereitung, 2D-Elektrophorese, Quantifizierung, DIGE, Massenspektrometrie, Quantifizierung überstabile Isotope, Protein-Microarrays; Proteininteraktionen, Systembiologie Next-Generation-Sequenzierung von Viren- und Bakteriengenomen.

    Qualifikations- und Lernziele

    Die Studierenden sind in der Lage:

    • komplexe Analysetechniken aus dem Bereich der funktionellen Genom-, Expressions- und Proteinanalytik zu verstehen
    • diese in einen Zusammenhang zur Beschreibung des Status von biologischen Systemen zu stellen
    • Methoden aus den Bereichen Genomics und Proteomics im Kontext molekularbiologischer Fragestellungen zielorientiert anzuwenden.
    • interdisziplinäre Problemstellungen an der Schnittstelle von Technik und biologischen Systemen zu analysieren und Problemlösungen zu erarbeiten.
    • ganzheitliche Systemanalysen komplexer Netzwerke zwischen Genom und Proteom zu erfassen und zu bewerten
    • Systembiologische Forschungsansätze nachzuvollziehen und ihre Bedeutung für das Verständnis lebender Systeme zu erkennen
    • Softwareprogramme und Datenbanken aus den Bereichen Genomics/Proteomics kompetent zu nutzen
    • ethische Fragestellungen, die in Zusammenhang mit einer öffentlichen Diskussion im Kontext gentechnologischer Verfahren und Methoden stehen, sachorientiert zu bewerten und eine persönlich Stellung zu beziehen
    • in einem gentechnischen/proteinchemischen Labor verantwortungs-bewusst, sauber und unter Wahrung der grundlegenden Hygiene- und Sicherheitsregeln zu arbeiten.
    • sich über das Gefahrenpotential der im Praktikum verwendeten Substanzen zu informieren und mit diesen sachgerecht umgehen.
    Lerninhalte

    Genomics:

    • Genom-Projekte, Strategien der Genomsequenzierung; Transkriptom, Expressionsanalytik, SNP-Analytik, in situ-Hybridisierung, GFPTechniken Proteomics:
    • Probenvorbereitung, 2D-Elektrophorese, Quantifizierung, DIGE, Massenspektrometrie, Quantifizierung über stabile Isotope, ProteinMicroarrays; Proteininteraktionen, Systembiologie Praktikum:
    • Next-Generation-Sequenzierung von Viren- und Bakteriengenomen
    • 2-D-Gelelektrophorese mit Spot-Identifizierung
    Moduldauer (Semester)
    1
    Unterrichtssprache
    Deutsch
    Gesamtaufwand
    6 CrP; 180 Stunden, davon etwa 60 Stunden Präsenzzeit.
    Semesterwochenstunden
    4
    Lernformen

    Vorlesung 2 SWS, Praktikum 1 SWS, Seminar 1 SWS

    Geprüfte Leistung

    Prüfungsvorleistung: Erfolgreiche Teilnahme am Praktikum

    Prüfungsleistung: Klausur

    Bewertungsstandard

    Bewertung der Prüfungsleistung nach § 9 der Prüfungsordnung (Teil I)

    Häufigkeit des Angebots
    Einmal im Jahr
    Literatur
    • Wird in der Vorlesung bekannt gegeben
    Voraussetzungen

    MN1018 Biochemie für Bioinformatiker

    BI1007 Molekularbiologie

    BI2006 Bioanalytik